#SPOILER#
som også #2 sagde det, så er Comstock og Booker den samme person.
Måden alt dette er sket, er fordi at der findes forskellige dimensioner og der findes MANGE af dem (alle lystårnene i slutningen). Hver af de dimensioner bestemmer Booker sig enten for at blive genfødt eller ej, hvilket enten gør ham til Booker eller Comstock.
Comstock holder Elizabeth/Anna fanget, da han ikke vil have at hun kommer til at lave en tear tilbage til en anden dimension hvor han er booker og hun finder ud af hvad der foregår.
Hvis du også husker i starten, hvor Lutece og Lutece vil have dig til at flippe en mønt, der står hvor mange gange der er blevet slået krone/plat (kan ikke lige huske det), det svarer til antallet af gange hvor Booker har været der. Så han har gjort dette masser af gange.
Han bliver dræbt fordi at han jo ved genfødslen (babtism) kan blive til Comstock og for at det ikke skal kunne lade sig gøre igen, må de dræbe Booker og sørge for at han ikke kan blive til Comstock.
Men det lader jo så et spørgsmål tilbage. Vil Elizabeth så leve? Hvis Booker er død i alle dimensioner er det ikke sikkert, men hvis hun er født efter hans død er der en mulighed for at mindst en Elizabeth i en dimension overlever.
Hvis du ser stykket efter rulleteksterne ser det faktisk ud som en drøm eller bare en ny dimension af Booker, hvor han går ind for at se om Anna Dewitt ligger i sin krybbe. Man ser ham kun åbne døren og så slutter det. Så på det punkt er det meget usikkert om hvorvidt det var en drøm eller en anden dimension han poppede op i igen (det kan også bare være en drøm :P)
Ellers kig på den meget bedre og detaljerede forklaring (med masser af fysik og andet):
http://www.youtube.com[...]
Btw utrolig sørgelig slutning, fældede sgu en tåre ved slutningen, for man bliver jo godt knyttet til personerne og man vil jo gerne have at det går dem godt :')
--
I got squat!